O Festival Córtex homenageia anualmente trabalhos de autor, com a exibição de médias e curtas-metragens do realizador e apresenta filmes em competição nacional, competição internacional e uma nova secção competitiva: a competição nacional de estreias, com filmes portugueses que vão ser exibidos pela primeira vez neste certame.

Além das secções competitivas, o Festival apresenta ainda:

– secção Hemisfério, programada pelo festival DocLisboa e que apresenta curtas documentais;

– a secção Frontal, dedicada a um público específico;

– e o Mini-Córtex com curtas-metragens para as escolas e uma sessão para pais e filhos.