A origem e impacto da domesticação do cão é uma questão que tem gerado amplo debate no seio da arqueologia. Saber se o cão Ibérico deriva dos seus ancestrais do Médio Oriente, ou da Ásia. Descobrir se há domesticação local de lobo na Península Ibérica, ou se as populações selvagens se misturaram com animais domesticados importados de outros locais, são algumas das questões que o projecto WOOF procura responder.
Através da Arqueogenética, que realiza análises genómicas em amostras de ossos recuperados em sítios arqueológicos, os investigadores poderão distinguir e caracterizar a evolução e estrutura das primeiras populações de cães, e dos seus ancestrais lobos, desde o Paleolítico Superior até épocas mais recente.
Compreender as trajetórias evolutivas de populações de cães e lobos, é fundamental para conhecer os movimentos migratórios dos nossos antepassados, e o modo como interagiram com o meio ambiente.