Situada fora de portas, na encosta do lado poente, a sua origem perde-se no tempo. A tradição afirma ter sido um templo romano dedicado a Júpiter, havendo a memória de terem existido nesta igreja várias lápides com inscrições romanas.

Foi sede da paróquia de São João Baptista (do Mocharro) até 1636, altura em que se transferiu para a antiga capela de São Vicente dos Gafos na entrada sul da vila, ficando a partir dessa data com a invocação de Nossa Senhora do Carmo. Foi também muito afetada pelo terramoto de 1755, resultando a sua feição atual das obras de reintegração que sofreu em meados do século XX, por ação da Direção Geral dos Edifícios e Monumentos Nacionais.

A antiga imagem do orago, São João Baptista, é uma notável escultura de meados do século XV de provável origem coimbrã, encontrando-se hoje no Museu Municipal. No exterior, junto à cabeceira, ergue-se o campanário medieval.

Fonte: Município de Óbidos