São dois os baptistérios identificados na velha Egitanea, sendo por este nome conhecida a cidade visigótica. Um deles está situado junto à fachada Norte da Catedral, desconhecendo-se a data da sua construção, para a qual se  reaproveitaram materiais da cidade romana imperial. Foi abandonado nos finais do século IV, inícios do século V. É uma piscina rectangular, com degraus de acesso nos lados menores, revestida a opus signinum (argamassa de impermeabilização) com o fundo em mármore. O segundo baptistério foi construído nos inícios do século V, também ele reaproveitando placas de mármore da cidade imperial. Tem uma planta cruciforme e conservou, até há bem pouco, vestígios da pintura original. Ambos são liturgicamente próximos e funcionalmente idênticos: uma pequena piscina com degraus, na qual entravam os catecúmenos, pelo lado poente, recebendo a tríplice infusão – simbolizando o rito purificatório da imersão – e saindo pelo lado oposto. No baptistério sul os sacerdotes ocupariam os espaços lobulados laterais. A investigação arqueológica ainda não contextualizou estes dois baptistérios, exemplares dos mais antigos do nosso território, sendo aceite que pertenceram a estruturas anteriores à Catedral (Igreja de Santa Maria).